Key points are not available for this paper at this time.
يحتوي برنامج NIP على عدة طرق لتعريف والبحث عن النماذج (, , , )، ويحتوي أيضًا على عدد من النماذج "المضمّنة" المعرفة مسبقًا والتي يمكن اختيارها كعمليات بحث منفصلة. تُوصف هنا عمليات البحث عن نسب التطابق مع تسلسلات التوافق، واستخدام مصفوفات الدرجات، وإنشاء واستخدام مصفوفات الأوزان للنيوكليوتيدات والثنائيات النوكليوتيدية (انظر الملاحظة 7). بالإضافة إلى ذلك، تُقدم تفاصيل عن النماذج "المضمّنة" المتاحة في البرنامج. غطى الفصل السادس عمليات البحث عن التطابقات الدقيقة لتسلسلات التوافق من خلال شرح كيفية العثور على تسلسلات التعرف لإنزيمات التقييد. عند البحث عن التطابقات الدقيقة أو نسب التطابق، أو استخدام مصفوفة الدرجات، يمكن أن يتضمن سلسلة البحث أو تسلسل التوافق رموز التكرار IUB. تنتج جميع عمليات البحث مخرجات مدرجة ورسومية. تعرض المخرجات المدرجة التسلسل المطابق وموقعه، وترسم المخرجات الرسومية صندوقًا يمثل طول التسلسل وتضع خطوطًا عمودية داخل الصندوق عند مواقع التطابقات. تكون ارتفاعات الخطوط متناسبة مع درجة التطابق (انظر الشكل 1).
درس رودجر ستادن (سات،) هذا السؤال.