الهيكل الجيني لفئران الهجين المولد معزولة: خرائط توافق عالية الدقة لتحليل الصفات المعقدة

خلفية: تُعتبر سلالات الفئران المولد معزولة (RI) موردًا مهمًا يُستخدم لتخطيط وتحليل الصفات المعقدة. وقد أثبتت فعاليتها بشكل خاص في الدراسات الجينية متعددة التخصصات. وقد أعاقت الأعداد المحدودة من سلالات RI والاستخدام الواسع لها صعوبة دمج النتائج المستمدة من مجموعات RI المختلفة. النتائج: قمنا بزيادة كثافة علامات الميكروساتليت المفحوصة بمقدار من مرتين إلى خمس مرات في كل من عدة مجموعات رئيسية من RI التي تشترك في سلالة أبوية C57BL/6 (AXB, BXA, BXD, BXH وCXB). تم تحديد مجموعة شائعة من 490 علامة في أكثر من 100 سلالة RI. تم توليد وجمع والتحقق من الأخطاء في الجينومات لحوالي 1,100 ميكروساتليت إضافي في مجموعة واحدة أو أكثر من RI. تم تجميع خرائط RI توافقية تدمج الجينومات لحوالي 1,600 موضع ميكروساتليت. عادةً ما تضم جينومات السلالات الفردية 45-55 نقطة انفصال عن إعادة التركيب. تحتوي مجموعة RI التي تم جمعها - والتي تحمل اسم مجموعة BXN - على حوالي 5,000 نقطة انفصال. يقترب توزيع حالات إعادة التركيب من توزيع بواسون، ومتوسط المسافات بين نقاط الانفصال حوالي 0.5 سنتيمورغان (cM). تم تحديد مواقع معظم نقاط الانفصال بدقة < 2 cM. تنحرف الجينومات عن توازن هاردي-واينبرغ في عدد قليل فقط من الفترات. الاستنتاجات: تتطابق الخرائط التوافقية المستمدة من سلالات RI تقريبًا مع التوقعات النظرية وقريبة من الطول المتوقع وفقًا لمعادلة هالدين-وادينغتون (x3.6 لفترة بين علامات من 2-3 cM). تُدخل الروابط غير المتناظرة بين الكروموسومات المختلفة تشوهات قابلة للتوقع في مجموعات بيانات موضع الصفات الكمية (QTL) التي يمكن تصحيحها جزئيًا باستخدام مصفوفات الارتباط الثنائية.