Key points are not available for this paper at this time.
الخلفية: تحديد الجيوب على أسطح البروتين ذو أهمية كبيرة لتطبيقات تصميم الأدوية المستندة إلى البنية وخوارزميات ارتباط البروتين-الليجند. على مدى السنوات العشر الماضية، تم تطوير العديد من الطرق الهندسية لتنبؤ مواقع ارتباط اللجند. النتائج: نقدم LIGSITEcsc، وهو توسيع وتنفيذ لخوارزمية LIGSITE. يعتمد LIGSITEcsc على مفهوم أحداث السطح-المذيب-السطح ودرجة المحافظة للرسائل السطحية المعنية. نقارن خوارزميتنا بأربعة نهج أخرى، LIGSITE وCAST وPASS وSURFNET، ونقيم جميعها على مجموعة بيانات تتضمن 48 بنية غير مرتبطة / مرتبطة و210 بنية مرتبطة. أداء LIGSITEcsc أفضل قليلاً من الأدوات الأخرى ويحقق معدل نجاح قدره 71% و75% على التوالي. الخلاصة: يؤدي استخدام سطح كونولي إلى تحسينات طفيفة، بينما يؤدي إعادة ترتيب التنبؤ وفقاً للمحافظة إلى تحسينات كبيرة في توقعات مواقع الارتباط. يتوفر خادم ويب لـ LIGSITEcsc ورمز المصدر الخاص به على scoppi.biotec.tu-dresden.de/pocket.
درس هوانغ وآخرون (سون) هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: