نماذج جديدة لتشفير RNA تتضمن RNA نووي صغير.

تم تحليل تسلسلات النيوكليوتيدات لـ RNAs النووية الصغيرة الثديية (snRNAs) باستخدام برنامج حاسوبية لتوافقها مع التسلسلات المحيطة بنقطة الربط لسابقة mRNA مختلفة (pre-mRNAs). يمكن أن تشكل منطقة في RNA U2 أو بعض snRNAs الأخرى أزواج قاعدية مع كل من الإكسونات المحيطة بالإنترون لسابقة معينة من mRNA، وبهذا، يمكن أن تقوم بمحاذاة النقاط الربط مما يؤدي إلى التشفير الصحيح للـ pre-mRNA. هذه النتائج تقترح أن snRNA مثل U2 يمكن أن تشارك في التشفير لبعض الـ pre-mRNAs من خلال الاقتران مع الإكسونات، وهو ما نسميه نموذج "إكسون" للتشفير، مقارنةً بالنموذج الذي يتضمن RNA U1 كما قدمه ليرنر وآخرون. ليرنر، م. ر.، بويل، ج. أ.، ماونت، س. م.، وولين، س. ل. & ستايتز، ج. أ. (1980) الطبيعة (لندن) 283، 220-224. أنشأنا نموذج هيكلي ثانوي لـ RNA U1 ودرسنا قدرة الاقتران القائم على تسلسلات RNA U1 الأولية والثانوية. نقدم نموذج بديل للتشفير الذي يتضمن RNA U1، والذي يفترض الاقتران بين مناطق غير متجاورة من RNA U1 مع إنترون من الـ pre-mRNA. يمكن أن يفسر اقتران snRNA مع الإكسونات المطابقة الصحيحة لنقطتي الربط اللتين ترتبطان بنفس الإنترون، وهو ما لا يفسره الاقتران مع تسلسلات الإجماع عند أطراف الإنترون كما اقترحه ليرنر وآخرون. قد يحدث اقتران إنترون مع RNA U1 واقتران الإكسونات المحيطة مع snRNA أخرى مثل RNA U2 في نفس الوقت لضمان خصوصية التشفير.