تحليل تكاملي قائم على تعلم الآلة للميثيلوم والترانسكريبتوم يكشف عن علامة ميثيلation جديدة تنبؤية في الورم الميلاني القزحي

الورم الميلاني القزحي (UVM) هو أكثر أنواع السرطان البشري داخل العين شيوعًا مع معدل وفيات مرتفع. لقد ظهرت الميثيلation غير الطبيعية بسرعة كعلامة تشخيصية وتنبؤية في العديد من أنواع السرطان. ومع ذلك، تبقى مثل هذه العلامة للميثيلation في UVM محدودة. في هذه الدراسة، قمنا بإجراء تحليل تكاملي على مستوى الجينوم للميثيلوم والترانسكريبتوم وحددنا 40 جينًا تنبؤيًا يقوده الميثيلation (MDPGs) مرتبطًا بتكون الورم وتقدم UVM. ثم اقترحنا استراتيجية اكتشاف وتحقق قائمة على تعلم الآلة لتحديد علامة مدفوعة بالميثيلation (10MeSig) تتكون من 10 MDPGs (AZGP1، BAI1، CCDC74A، FUT3، PLCD1، S100A4، SCN8A، SEMA3B، SLC25A38 و SLC44A3)، والتي قسمت 80 مريضًا من مجموعة الاكتشاف إلى نوعين من المخاطر مع اختلاف كبير في البقاء العام (HR = 29، 95% CI: 6.7-126، P < 0.001). تم التحقق من صحة 10MeSig في مجموعة مستقلة تحتوي على 57 مريضًا وكانت النتيجة قيمة تنبؤية مشابهة (HR = 2.1، 95% CI: 1.2-3.7، P = 0.006). أظهرت تحليل الانحدار المتعدد المتغيرات Cox أن 10MeSig هو عامل تنبؤي مستقل لبقاء المرضى المصابين بـ UVM. مع دراسة تحقق مستقبلية، ستحسن هذه الـ 10MeSig القرارات السريرية وتوفر رؤى جديدة حول آلية تطور UVM.