Key points are not available for this paper at this time.
تحالف الصحة العامة لعلم الأوبئة الجينومي (PHA4GE) (https://pha4ge.org) هو ائتلاف عالمي يعمل بنشاط على وضع معايير توافقية، وتوثيق ومشاركة أفضل الممارسات، وتحسين توفر أدوات وموارد المعلوماتية الحيوية الهامة، والدعوة إلى مزيد من الانفتاح، والتشغيل المتداخل، وسهولة الوصول، وإمكانية إعادة الإنتاج في المعلوماتية الحيوية الميكروبية للصحة العامة. في مواجهة الوباء الحالي، حددت PHA4GE حاجة واضحة وملحة لمعيار بيانات سياقية مفتوح المصدر ملائم أغراض SARS-CoV-2. بناءً عليه، قمنا بتطوير تمديد لحزمة مسببات الأمراض INSDC، يقدم مواصفة بيانات سياقية لـ SARS-CoV-2 تستند إلى معايير مجتمعية يمكن harmonisable، ومتاحة للجمهور. يمكن تنفيذ هذه المواصفة من خلال نموذج جمع، بالإضافة إلى مجموعة من البروتوكولات والأدوات لدعم التنسيق وتقديم بيانات السلسلة والمعلومات السياقية إلى المستودعات العامة. تضيف البيانات السياقية الغنية والمنظمة قيمة، وتعزز إعادة الاستخدام، وتمكن من تجميع ودمج مجموعات البيانات المتباينة. ستساعد تبني المعيار والممارسات المقترحة على تحسين التشغيل المتداخل بين مجموعات البيانات والأنظمة، وتحسين اتساق وفائدة البيانات الناتجة، وفي النهاية تسهيل رؤى واكتشافات جديدة في SARS-CoV-2 وCOVID-19.
قام غريفيث وآخرون (Sun) بدراسة هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: