طريقة جديدة لتحسين حسابات الطاقة التشكيلية للبوليببتيدات: تلدين الفضاء التشكلي

تُقدم طريقة جديدة لتحسين البحث عن التشكيلات ذات الطاقة الأدنى العالمية للبوليببتيدات. تجمع هذه الطريقة بين الجوانب الأساسية لإجراء البناء والخوارزمية الجينية، وتُدخل المفهوم المهم ل”تلدين الفضاء التشكلي.” بدلاً من النظر إلى تشكيل واحد، يتم التركيز على مجموعة من التشكيلات بينما يتم الحصول على تشكيلات جديدة من خلال تعديل “تشكيل البذور.” يُجرى التلدين عن طريق إدخال حد مسافة، Dcut، والذي يتم تعريفه في الفضاء التشكلي؛ حيث يقوم Dcut فعليًا بتقسيم كامل الفضاء التشكلي للحدود المحلية إلى تقسيمات. يتم تعيين قيمة Dcut لرقم كبير في بداية الخوارزمية لتغطية كامل الفضاء التشكلي، ويتم تحقيق التلدين عن طريق تقليلها ببطء. يتم دراسة العديد من الحدود المحلية المتميزة المصممة لتكون موزعة بأقصى قدر ممكن من البعد في الفضاء التشكلي في آن واحد. لذلك، تجد الطريقة الجديدة ليس فقط التركيب الأدنى العالمي للطاقة ولكن أيضًا العديد من الحدود المحلية المتميزة كمنتجات جانبية. تم اختبار الطريقة على ميت-إنكيفالين، وهو مشكلة زوايا ثلاثية وعشرون. في جميع العمليات الـ100 المستقلة، تم الحصول على التركيب المقبول للطاقة الأدنى العالمية بعد حوالي 2600 تقليل في المتوسط. © 1997 جون وايلي وأولاده، إنك. J Comput Chem 18: 1222–1232