Key points are not available for this paper at this time.
الخلفية: أدت تقنيات التسلسل من الجيلين الثاني والثالث إلى ثورة في علم الجينوم الجرثومي. تسلسلات إلومينا القصيرة تؤدي إلى تجميعات رخيصة ولكن مجزأة، بينما هذه التسلسلات الأطول تكون أغلى لكنها تؤدي إلى جينومات أكثر اكتمالا. جهاز أكسفورد نانوبور MinION هو جهاز تسلسل محمول ثوري يمكنه إنتاج آلاف من التسلسلات الطويلة المكونة من جزيئات فردية. النتائج: قمنا بتسلسل سلالة بكتيرويد fragilis BE1 باستخدام كل من منصتي إلومينا MiSeq وأكسفورد نانوبور MinION. تمكنا من تجميع كروموسوم واحد بحجم 5.18 ميغاباز، بدون فجوات، باستخدام برمجيات متاحة للجمهور وأجهزة حاسوب تجارية. حددنا إعادة ترتيب الجينات وحالة المحفزات القابلة للعكس في السلالة. الاستنتاجات: تم تحقيق تجميع الكروموسوم الواحد لفرقة بكتيرويد fragilis BE1 باستخدام كميات متواضعة فقط من البيانات، وبرمجيات متاحة للجمهور، وأجهزة حاسوب تجارية. يوفر هذا المزيج من التقنيات إمكانية الحصول على جينومات جرثومية ذات جودة عالية وبأسعار منخفضة جداً.
درس ريس وآخرون (الثلاثاء) هذا السؤال.