تحليل تسلسل جينات التعبئة/الإنهاء للبكتريوفاج T4 يكشف مركز ATPase مشترك في الوحدة الفرعية الكبيرة من إنهاء الفيروسات

يُعتقد أن تعبئة DNA الفاج مدفوعة بجهاز دوار مرتبط بـ 'محرك' ATPase. تشير الأدلة الحديثة إلى أن محرك تعبئة DNA الفاج هو أحد أقوى المحركات الجزيئية المولدة للقوة المبلغ عنها حتى الآن. ومع ذلك، فإن مركز ATPase المسؤول عن توليد هذه القوة غير معروف. من أجل تحديد ATPase الناقل لـ DNA، تم تحليل تسلسلات جينات التعبئة/الإنهاء للبكتريوفاجات T4 وRB49 وفيربيوفاجات KVP40 وKVP20. كشف محاذاة تسلسلات البوليببتيد للإنهاء عن عدد من التوقيعات الوظيفية في الجينات 16 و17. والأهم من ذلك، تقدم البيانات دليلًا قويًا على وجود مركز تحفيزي ATPase في النصف الطرفي N للوحدة الفرعية الكبيرة من إنهاء gp17. تم تحديد نطاق ATPase مماثل يتكون من توقيعات وظيفية محفوظة في الوحدة الفرعية الكبيرة لإنهاء بكتريوفاجات وفيروسات الهربس الأخرى. من المثير للاهتمام، أن نطاق ATPase المشتبه به يظهر بعض الميزات الشائعة الموجودة في نطاق ATPase من إنزيمات DEAD box helicases. تم تحديد بقايا قد تكون حاسمة لتحفيز ATPase وترابطها بتعبئة DNA. يُظهر التحوير التبادلي أن بقايا الثريونين المتوقعة في نمط الارتباط بـ ATPase المشتبه به هي في الواقع حاسمة لوظيفتها.