هيكل بروتين الأبوليبوبروتين B-100 في البروتينات الدهنية منخفضة الكثافة

هناك توافق عام على أن الحلزونات الألفا الأمفيوية والأوراق البيتا تمثل الأنماط الرئيسية المرتبطة بالدهون لبروتين الأبوليبوبروتين (أبو) B-100. في هذه المراجعة، نقوم بفحص الأدلة التجريبية والمحوسبة الموجودة هيكل المجال الخماسي الأقسام لبروتين أبوB. في التسمية الخماسية المقدمة في هذه المراجعة (NH(2)-بيتا ألفا(1)-بيتا(1)-ألفا(2)-بيتا(2)-ألفا(3)-COOH)، تم توسيع المجال الكروي الأصلي ألفا(1) (Segrest, J. P. et al. 1994. Arterioscler. Thromb. 14: 1674;-1685) ليشمل البقايا 1;-1,000 وإعادة تسميته المجال البيتا ألفا(1). يعكس هذا التغيير الاحتمالية أن المجال البيتا ألفا(1)، مثل لامبري ليبوفيلين، هو مركب كروي من الهياكل الثانوية الحلزونية الألفا والأوراق البيتا التي تساهم في تراكم الدهون في جزيئات البروتينات الدهنية الغنية بالدهون الثلاثية التي تم تجميعها عبر الترجمة. يتم تقديم أدلة على أن الوجوه الكارهة للماء للأوراق البيتا الأمفيوية من المجالات بيتا(1) وبيتا(2) لبروتين أبوB-100 هي في اتصال مباشر مع القلب الدهني المحايد للبروتينات الدهنية المحتوية على بروتين أبوB وتلعب دورًا في تنظيم القلب الدهني. كما يتم تقديم أدلة على أن هذه الأوراق البيتا تحدد إلى حد كبير قطر جزيء LDL. تظهر تحليل البيانات المنشورة أنه مع تقليل حجم الجزيء، هناك زيادة في عدد الحلزونات الأمفيوية من المجالات ألفا(2) و ألفا(3) المرتبطة بالدهون السطحية لجزيء LDL؛ هذه الزيادات تعدل انخفاض ضغط السطح الناتج عن تقليل نصف قطر الانحناء. كما يتم مناقشة خصائص منطقة ربط مستقبلات LDL ضمن الهيكل العام لمجال بروتين أبوB-100. أخيرًا، يتم مناقشة نماذج ثلاثية الأبعاد حديثة لجزيئات LDL تم الحصول عليها بواسطة مجهر الإلكترونات الفائقة البرودة وبلورة الأشعة السينية. تُظهر هذه النماذج ثلاث ميزات شائعة: شكل شبه قرصي، وزر سطحي بأبعاد مجال بيتاC الكروي لليبوفيلين، وطبقات مستوية في القلب الدهني التي تتباعد بحوالي 35 A؛ يُعتقد أن الطبقات تمثل استر الكوليسترول في المرحلة السميكية. تعرض هذه النماذج معضلة: هل جزيئات LDL الدائرة عند 37 درجة مئوية لها شكل كروي، كما هو مفترض عمومًا، أم هل لها شكل شبه قرصي، كما تشير النماذج؟ تدعم الأدلة المحدودة المتاحة الشكل الكروي.