Key points are not available for this paper at this time.
خلفية: كان تحديد الاضطرابات الجينومية في عدد النسخ (CNAs) من عينات السرطان ضرورياً لتحديد جينات كابحة الأورام والجينات المسرطنة، وقد ثبت أنه مفيد لرصد العلامات السريرية. لقد قامت عدد متزايد من المشاريع برسم خرائط للـ CNAs باستخدام تقنيات الميكروأري عالية الدقة. حتى الآن، لا توجد مورد واحد يوفر مجموعة عالمية من بيانات الميكروأري للجينات المسرطنة القابلة للوصول بسهولة. المنهجية / النتائج الرئيسية: نقدم هنا arrayMap، وهو قاعدة بيانات مرجعية منظمة وموارد معلومات حيوية تستهدف بيانات رسم الخرائط لعدد النسخ في السرطان البشري. توفر قاعدة بيانات arrayMap منصة لإجراء التحليل التجميعي ودمج البيانات على مستوى الأنظمة لبيانات CNAs للجينات المسرطنة عالية الدقة. حتى الآن، تحتوي هذه الموارد على أكثر من 40,000 ميكروأري في 224 نوعاً من السرطان مستخرجة من عدة مصادر، بما في ذلك مجموعة بيانات التعبير الجيني (GEO) التابعة لـ NCBI، وArrayExpress (AE) التابعة لـ EBI، وThe Cancer Genome Atlas (TCGA)، والملحقات الخاصة بالمنشورات، والتسليمات المباشرة. لتسهيل مراجعة بيانات الجينات على مستوى الجين وبيانات الجينوم بشكل عام، يتم تسهيل مستوى البيانات وعرضها المتكامل للغالبية العظمى من مجموعات البيانات المشمولة. يمكن ربط نتائج اختيارات متعددة بالحالات بأدوات تحليل البيانات وعرضها. الاستنتاجات / الأهمية: على حد علمنا، لا توجد حالياً أي مصدر بيانات يوفر مجموعة شاملة من بيانات الـ CNAs عالية الدقة للجينات المسرطنة التي يمكن استخدامها بسهولة لتعدين الخصائص الجينومية، عبر نطاق تمثيلي من الكيانات السرطانية. يمثل arrayMap جهدنا لتوفير منصة طويلة الأمد لبيانات CNAs للجينات المسرطنة بغض النظر عن اعتبارات النظام الأساسي المحدد أو الاعتماد على مشروع معين. يمكن الوصول إلى قاعدة البيانات عبر الإنترنت على http//www.arraymap.org.
درس كاى وآخرون (الجمعة) هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: