Key points are not available for this paper at this time.
الخلفية: تلعب الأجسام المضادة (IG) ومستقبلات خلايا T (TR) دوراً رئيسياً في التعرف على المستضدات خلال الاستجابة المناعية التكيفية. لقد قدم التقدم الأخير في تقنيات تسلسل الجيل القادم فرصة لتحليل عميق لتنوع مستقبلات خلايا T. ومع ذلك، مطلوب برنامج متخصص للتحليل المنطقي للبيانات الضخمة الناتجة عن تسلسل الجيل القادم. النتائج: هنا نقدم tcR، وهي حزمة R جديدة تمثل منصة للتحليل المتقدم لتنوع مستقبلات خلايا T، والتي تشمل مقاييس التنوع، وتحديد تسلسلات مستقبلات خلايا T المشتركة، وحساب إحصائيات استخدام الجينات وأساليب أخرى تستخدم على نطاق واسع. لقد أثبتت الأداة فائدتها في الدراسات البحثية الحديثة. الاستنتاجات: tcR هي حزمة R للتحليل المتقدم لتنوع مستقبلات خلايا T بعد استخراج تسلسلات TR الأولية من قراءات التسلسل الخام. يمكن تثبيت النسخة المستقرة مباشرة من شبكة الأرشيف الشامل لـ R (http://cran.r-project.org/mirrors.html). الكود المصدر وإصدار التطوير متاحان في tcR GitHub (http://imminfo.github.io/tcr/) مع الوثائق الكاملة وأمثلة الاستخدام النموذجية.
درس نازاروف وزملاؤه (الخميس) هذا السؤال.
Synapse has enriched 5 closely related papers on similar clinical questions. Consider them for comparative context: