Key points are not available for this paper at this time.
الدافع: تركز قواعد البيانات الحالية في علم الأحياء الجزيئي على التسلسل والجوانب الهيكلية للجزيئات الكبيرة الحيوية، مثل DNA و RNA والبروتينات. ومع ذلك، لفهم الجوانب الوظيفية، من الضروري حوسبة تفاعل هذه الجزيئات. علاوة على ذلك، تحتوي الخلايا الحية على جزيئات إضافية، مثل المركبات الأيضية وأيونات المعادن، التي يمكن اعتبارها أيضًا أجزاء من اللبنات الأساسية للحياة، لكنها ليست منظمة جيدًا في قواعد البيانات العامة. قاعدة بيانات LIGAND الكيميائية هي محاولتنا لحل هذه المشكلات، على الأقل لتفاعلات الإنزيم. النتائج: تتكون LIGAND من قسمين: الإنزيم والمركب. قسم الإنزيم هو امتداد للدراسات السابقة (Suyama et al., Comput. Applic. Biosci., 9, 9-15, 1993)، وهو تمثيل بملف عادي لعدد 3303 إنزيمات و 2976 تفاعل إنزيمي بصيغة المعادلات الكيميائية التي يمكن للم机اينة تحليلها. تم إنشاء قسم المركب حديثاً لمعلومات حول التسمية والهياكل الكيميائية للمركبات. يحتوي على 5383 مركب كيميائي. تحتوي كل من مدخلات الإنزيم والمركب على معلومات مرجعية غنية، يتم توليد معظمها تلقائيًا بواسطة نظام DBGET/LinkDB، مما يوفر الربط بين قواعد البيانات الكيميائية والبيولوجية. يتم تحديث LIGAND يوميًا، مرتبطًا ارتباطًا وثيقًا بقاعدة بيانات مسارات الأيض KEGG، ويشكل الأساس لإعادة بناء وحساب المسارات. التوفر: يمكن الوصول إلى LIGAND من خلال أنظمة DBGET/LinkDB و KEGG في خدمة قاعدة بيانات GenomeNet اليابانية عبر http://www.genome.ad.jp/. يمكن تنزيل تنسيق ملف LIGAND عبر FTP مجهول عبر ftp://kegg.genome.adjp/molecules/ligand/. الاتصال: goto@kuicr.kyoto-u.ac.jp; nishioka@scl.kyoto-u.ac.jp; kanehisa@kuicr.kyoto-u.ac.jp
قام Goto et al. (الخميس) بدراسة هذا السؤال.