تاكسونستان: حزمة r لتوحيد أسماء الأنواع في قواعد بيانات النباتات

الملخص 1. ساهمت تجميع قواعد بيانات النباتات بشكل كبير في تقدم علم النباتات في جميع أنحاء العالم. ومع ذلك، تنجم المشكلات المنهجية عن استخدام أسماء النباتات، لا سيما في البيانات التي تأتي من مصادر متعددة وغير متجانسة. واحدة من المشكلات الرئيسية هي العدد المفرط من الأسماء المرادفة التي يمكن العثور عليها في قوائم النباتات. 2. نقدم تاكسونستان، وهي حزمة r لتوحيد أسماء النباتات تلقائيًا باستخدام قائمة النباتات (http://www.theplantlist.org). تتيح السكربتات المضمنة في هذه الحزمة الاتصال بمحرك البحث عبر الإنترنت لقائمة النباتات واسترجاع معلومات عن كل نوع بشأن حالته التصنيفية الحالية. في الحالات التي يكون فيها اسم النوع مرادفًا، يتم استبداله بالاسم المقبول حاليًا. بالإضافة إلى ذلك، يمكن أن تساعد هذه الحزمة في تصحيح الأخطاء الإملائية في الصفات المحددة. 3. تسهل هذه الأداة بشكل كبير إعداد قواعد بيانات نباتية كبيرة قبل تحليلها، لا سيما عندما تغطي مناطق جغرافية واسعة (على نطاق فوق وطني أو حتى قاري) أو تحتوي على بيانات من مناطق ذات نباتات غنية حيث لم يتم حل المشكلات التصنيفية للعديد من أنواعها. يمكن أن تسهل تدفقات العمل الآلية مثل تلك المقدمة من حزمة تاكسونستان هذه المهمة بشكل كبير باستخدام قائمة سلطة تسميات نباتية يمكن الوصول إليها على نطاق واسع مثل قائمة النباتات.