توقيعات التفاعلات n→π* في البروتينات

توجه طي البروتينات مجموعة متنوعة من التفاعلات، بما في ذلك الروابط الهيدروجينية، والإلكتروستاتيكا، وتفاعلات فان der Waals، والأثر الكاره للماء. لقد جادلنا سابقًا أنه يجب إضافة تفاعل n→π* بين مجموعات الكربونيل إلى هذه القائمة. في تفاعل n→π*، تتداخل الزوج الوحيد (n) من أكسجين الكربونيل مع المدار المضاد للرابطة π* لمجموعة كربونيل أخرى. إن ميل مجموعات الكربونيل في الهيكل العظمي للبروتينات للانخراط في هذا التفاعل له عواقب على هياكل البروتينات المطوية التي نكشفها هنا. أولاً، نستخدم نظرية الكثافة الوظيفية لإظهار أن تفاعل n→π* يسبب انحراف كربون الكربونيل عن المستوى. ثم، نكتشف هذه العلامة لتفاعل n→π* في هياكل بروتينات عالية الدقة. أخيرًا، نوضح من خلال التحليل السكاني الطبيعي أن تفاعل n→π* يسبب استقطاب كثافة الإلكترون في مجموعات الكربونيل ونكشف عن ذلك الاستقطاب في خريطة كثافة الإلكترون لأكسيد الكوليسترول، مما يؤكد أكثر وجود تفاعلات n→π*. نستنتج أن تفاعل n→π* فعال في البروتينات المطوية.