Key points are not available for this paper at this time.
الملخص تعتمد نسخ الجينات الفراغية القائمة على تداخل RNA على حساسية الكشف غير المسبوقة. ومع ذلك، فإن عدم الدقة في تقسيم أحجام الصور إلى خلايا يؤدي إلى إعادة تخصيص المRNAs بشكل خاطئ، وهو مصدر رئيسي للأخطاء. هنا نطور JSTA، وهو إطار حسابي لتقسيم الخلايا المشترك وتوصيف نوع الخلايا يستخدم المعرفة السابقة بتعبير الجينات المحدد لنوع الخلايا. تُظهر نتائج المحاكاة أن الاستفادة من تصنيف أنواع الخلايا الموجودة يزيد من دقة تخصيص RNA بأكثر من 45%. باستخدام JSTA، تمكنا من تصنيف الخلايا في الحُصين الفأري إلى 133 (نوع فرعي) كاشفين عن التنظيم المكاني لأنواع خلايا CA1 وCA3 وSst. تم تحليل التعبير الجيني المكاني التفاضلي داخل نوع الخلايا الفرعي لـ 80 جينًا مرشحًا وتم تحديد 43 منها ذات تعبير جيني مكاني تفاضلي ذو دلالة إحصائية عبر 61 (نوع فرعي). بشكل عام، تُظهر أعمالنا أنه يمكن الاستفادة من أنماط تعبير نوع الخلايا المعروفة لتحسين دقة نسخ الجينات الفراغية القائمة على تداخل RNA مع توفير معلومات دقيقة جداً عن (أنواع فرعية) الخلايا. العدد الكبير من أنماط تعبير الجينات الفراغية الجديدة المكتشفة يبرر الحاجة إلى قياسات دقيقة للنسخ الجيني الفراغي التي يمكن أن تقدم معلومات تتجاوز تسميات (أنواع فرعية) الخلايا.
درس ليتمان وآخرون (Sun) هذا السؤال.