بروتين الأجريكان في الفئران، بروتين ضخم من الغضاريف: تسلسل البروتين، هيكل الجين وتسلسل المحفز

تم عزل سبعة كلوينات جينومية لبروتين الأجريكان الأساسي في الفئران بما في ذلك 3 كيلو قاعدة من تسلسلات الجناح 5'- و 7 كيلو قاعدة من تسلسلات الجناح 3'-. تم تحديد ورسم جميع تسلسلات الإكسونات وحدودها الداخلية في هذه الكلوينات من خلال تسلسل الحمض النووي. يمتد الجين على الأقل 61 كيلو قاعدة ويحتوي على 18 إكسون. الإكسون 1 يشفر تسلسلاً غير مترجم بطول 5'- ويحتوي الإكسون 2 على كودون بدء الترجمة، ميثيونين. التسلسل المشفر هو 6545 قاعدة لحمض أميني مكون من 2132 حمض أميني مع وزن جزيئي محسوب M(r) = 259,131 بما في ذلك ببتيد إشارة مكون من 18 حمض أميني. هناك علاقة قوية بين المجالات الهيكلية والإكسونات. من الجدير بالذكر أن مجال كبريتات الغضاريف المكون من 1161 حمض أميني مشفر بواسطة إكسون واحد بحجم 3.6 كيلو قاعدة. على الرغم من أن بروتين الارتباط يحتوي على مجالات هيكلية مماثلة وأجزاء فرعية، فقد أظهر هوية تسلسلية وتنظيم الإكسونات التي تشفر الأجزاء الفرعية B و B' في مجالات G1 و G2 تشابهًا قويًا بين الأجريكان في الفئران وكلاً من الفيرسيكان البشري والنوروكان الجرذي. حدد تحليل تمديد البرايمر أربعة مواقع لبدء النسخ قريبة من بعضها. أظهر تسلسل المحفز محتوى عالٍ من G/C (65%) واحتوى على عدة أنماط ربط توافقية لعوامل النسخ بما في ذلك Sp-1 ومستقبل الجلوكوكورتيكويد. هناك قطع من التسلسلات مشابهة لمنطقة المحفز لكل من جينات الكولاجين من النوع الثاني وبروتين الارتباط. قد تكون هذه التسلسلات مهمة للتعبير عن جينات الغضاريف.