آلية التحفيز لنقل الببتيد بواسطة الريبوسوم

يحفز الريبوسوم تفاعلين بيولوجيين أساسيين: نقل الببتيد، وهو تشكيل رابطة ببتيدية أثناء تخليق البروتين، والتحلل الببتيدي، وهو تحرير البروتين الكامل من tRNA الببتيدي عند انتهاء الترجمة. يتمكن الريبوسوم من استخدام وتمييز nucleophiles المختلفة لكل تفاعل، الأحماض الأمينية α-من tRNA الأحماض الأمينية الواردة مقابل جزيء الماء. يرتبط التفاعل الصحيح للركائز بتغيير هيكلي لرسائل الموقع النشط في الريبوسوم والركائز نفسها، مما يؤدي إلى توجيه ملائم للتحفيز. بالإضافة إلى ذلك، يبدو أن رسائل الموقع النشط توفر مساعدة إضافية من خلال ترتيب جزيئات الماء في الموقع النشط وتوفير بيئة كهربائية عبر شبكة هيدروجينية تثبت الوسطاء التفاعليين وربما تنقل البروتونات. لا زالت هناك أسئلة هامة حول توقيت ومكونات وآلية خطوات نقل البروتون. يلخص هذا الاستعراض التقدم الحديث في التطورات الهيكلية والكيميائية الحيوية والحسابية ويقدم النماذج الآلية الحالية لهذين التفاعلين.