هلوسة البروتينات المتكررة المغلقة التي تحتوي على جيوب مركزية

في البروتينات الزائفة الدورية، مثل براميل TIM، وبراميل β، وبعض القنوات الانتقالية الحلزونية، يتم تكرار وحدة فرعية واحدة بنمط دوري، مما ينتج عنه تجويف مركزي يمكن أن يعمل كجيب لارتباط الجزيئات أو النشاط الإنزيمي. مستوحاة من هذه البروتينات، وضعنا نهجًا قائمًا على التعلم العميق لاستكشاف نطاق البروتينات المتكررة المغلقة بدءًا من مجرد تحديد عدد التكرارات وطولها. البيانات الفيزيائية الحيوية لـ 38 تصميمًا زائفًا دوريًا متنوعًا تم إنتاجها في الإشريكية القولونية تتوافق مع نماذج التصميم، والهياكل البلورية الثلاثة التي تمكنا من الحصول عليها قريبة جدًا من الهياكل المصممة. تشير دراسات الرصيف إلى أن تنوع الطيات والجيوب المركزية يوفر نقاط انطلاق فعالة لتصميم روابط الجزيئات الصغيرة والإنزيمات.