آثار الشبكة المتقاربة على محور التعبير الجيني خلال تقدم سرطان البروستاتا

خلفية: يتم تحديد الانحرافات الجينومية الخاصة بالورم بانتظام من خلال قياسات الجينوم عالية الإنتاجية. لا يزال من غير الواضح كيف تؤثر التغييرات الجينومية المعقدة على الشبكات الجزيئية من خلال تغيير مستويات البروتين وبالتالي الحالات الكيميائية الحيوية لأنسجة الأورام. النتائج: هنا، نبحث في انتشار الآثار الجينومية على محور التعبير الجيني خلال تقدم سرطان البروستاتا. نحن نقوم بت quantifying التغيرات الجينومية والترانسكريبتومية والبروتينومية استنادًا إلى 105 عينات من البروستاتا ، تتكون من مناطق تضخم البروستاتا الحميد والأورام الخبيثة ، من 39 مريضًا بسرطان البروستاتا. تكشف تحليلاتنا عن الآثار المتقاربة للاختلافات المميزة في عدد النسخ التي تؤثر على بروتينات مشتركة أساسية لإقامة نمط ورمي. نحن نبتكر نهجًا قائمًا على الشبكات يدمج الاضطرابات عبر مستويات جزيئية مختلفة، والذي يحدد شبكة فرعية تتكون من تسعة جينات يتزامن نشاطها مع زيادة عدوانية الأنماط الورمية ويمكن أن يتنبأ بالبقاء الخالي من الانتكاس. علاوة على ذلك، تكشف بياناتنا عن طيف واسع من آثار الشبكة داخل المرضى، تتراوح من تغييرات مماثلة إلى تغييرات مميزة جدًا على مستويات جزيئية مختلفة. الاستنتاجات: تكشف هذه الدراسة عن الشبكات الجزيئية ذات التغيرات المتقاربة الكبيرة عبر مواقع الأورام والمرضى. كما تعرض تنوعًا في آثار الشبكة: لم نتمكن من تحديد شبكة فرعية واحدة تتأثر في جميع مناطق الأورام عالية الدرجة.