الخرشوف يظهر نقص في ميثلة الحمض النووي المركزي وتغيرات سيتولوجية في الهيتروكروماتين عند هجوم بكتيريا البسودوموناس سيرنجاي

تظهر أنسجة النبات تغيرات كبيرة عند إدراكها للميكروبات المسببة للأمراض. لقد تم وصف تغييرات في المكونات السيتوبلازمية والأبولستيكية التي تستشعر وتنقل دفاعات النبات بشكل موسع. في المقابل، توجد معلومات أقل عن التعديلات التي تؤثر على الجينوم النوي للنبات في هذه الظروف. هنا، تحققنا مما إذا كان حالة ميثلة الحمض النووي في الأرابيدوبسيس ثاليانا تتغير في الأنسجة التي تستجيب لهجوم بكتيريا البسودوموناس سيرنجاي pv. الطماطم DC3000. قمنا بتطبيق تحليل تباين طول الشظايا المعززة لمراقبة ميثلة السيتوزين في مواقع مجهولة 5'-CCGG-3' و5'-GATC-3' في عينات غير مصابة ومصابة. وتم عزل وتوصيف أجزاء من الجينوم النباتي التي تقلل الميثلة عند الإصابة، بما في ذلك التكرارات المحيطية/المركزية مثل وحدة الـ180-زوج قاعدي، والترنسوسون أثيلا، وجزء من الإدخال النووي للحمض النووي الميتوكوندري. وتم اكتشاف نقص الميثلة الذي تسببه بكتيريا البسودوموناس سيرنجاي pv. الطماطم من خلال اختبارات الكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء وعلى المستوى الجزيئي لم يبدو أنه يؤثر على جميع بقايا 5-ميثيل سيتوزين (5-mC) بشكل متساوٍ. أظهرت نوى الأنسجة المصابة تغيرات هيكلية في الكروماتين، بما في ذلك تليين مراكز الكروموسوم، التي كانت أيضاً محفزة بواسطة بكتيريا البسودوموناس سيرنجاي pv. الطماطم غير الفتاكة، ولكن ليس بواسطة الطفيل mutant hrpL- من بكتيريا البسودوموناس. وأخيراً، وُجد أن نقص الميثلة الناجم عن بكتيريا البسودوموناس pv. الطماطم يحدث في غياب استنساخ الحمض النووي، مما يشير إلى أنه يتضمن آلية ديميثلة نشطة. كل هذه الاستجابات حدثت بعد يوم واحد من الإصابة، مما تم توثيقه قبل الموت الجماعي الكبير لخلايا النبات الناتج عن هجوم الطفيل.