Key points are not available for this paper at this time.
تبدأ استعمار ميكروبيوم الأمعاء البشري عند الولادة، ومع مرور الوقت، تصبح هذه المجتمعات الميكروبية أكثر تعقيدًا. معظم ما نعرفه حاليًا عن الميكروبيوم البشري، خاصة في مراحل التطور المبكرة، تم وصفه باستخدام طرق التسلسل المستقلة عن الثقافة والتي تتيح لنا تحديد التركيب التصنيفي للمجتمعات الميكروبية باستخدام تقنيات الجينوم، مثل تسلسل الـ amplicon أو تسلسل الميتاجينوم بالأسلوب العشوائي. كل طريقة لها مزايا وعيوب مميزة، لكن لم يكن هناك مقارنة مباشرة لفائدة هذه الطرق في عينات البراز من الأطفال الصغار جدًا، الذين يتمتعون بخصائص مختلفة عن تلك الموجودة لدى البالغين. قمنا بمقارنة تأثيرات تحليل ميكروبيوم أمعاء الرضع البشري باستخدام تقنيات تسلسل 16S rRNA amplicon مقابل تسلسل الميتاجينوم بالأسلوب العشوائي في 338 عينة براز؛ أقل من 15، من 15 إلى 30، وأكبر من 30 شهرًا من العمر. نوضح أن التغيرات الملحوظة في التنوع ألفا وبيتا مع العمر تحدث بدرجات متشابهة باستخدام كلتا طريقتي التحليل. كما نوضح أن تحليل 16S rRNA قد حدد عددًا أكبر من الأجناس ونجد العديد من الأجناس التي يتم تجاهلها أو تمثيلها بشكل ناقص من قبل كل طريقة تحليل. نقدم الرابط بين تنوع ألفا وعمق تسلسل الميتاجينوم العشوائي للأطفال من أعمار مختلفة. توفر هذه النتائج دليلًا لاختيار الطريقة وعمق التسلسل المناسب للمجموعات العمرية الثلاث المدروسة.
قام بيترسون وآخرون (الخميس) بدراسة هذا السؤال.