إطار لأبحاث الميكروبيوم البشري

توجد مجموعة متنوعة من المجتمعات الميكروبية وجيناتها (الميكروبيوم) في جميع أنحاء جسم الإنسان، ولها أدوار أساسية في صحة الإنسان ومرضه. لقد أنشأ اتحاد مشروع الميكروبيوم البشري المدعوم من المعاهد الوطنية للصحة (NIH) إطارًا على مستوى السكان لتطوير بروتوكولات الميتاجينوم، مما أدى إلى مجموعة واسعة من الموارد والبيانات الخاضعة لمراقبة الجودة، بما في ذلك طرق موحدة لإنشاء ومعالجة وتفسير أنواع مختلفة من بيانات الميتاجينوم عالية الإنتاجية المتاحة للمجتمع العلمي. هنا نقدم موارد من سكان مكون من 242 بالغًا صحيًا أخذت عينات منهم في 15 أو 18 موقع جسدي حتى ثلاث مرات، مما أدى إلى توليد 5,177 ملف تصنيف ميكروبي من جينات rRNA 16S وأكثر من 3.5 تيرابايت من تسلسل الميتاجينوم حتى الآن. بالتوازي، تم تسلسل حوالي 800 سلالة مرجعية معزولة من جسم الإنسان. تمثل هذه البيانات مجتمعة أكبر مورد يصف وفرة وتنوع الميكروبيوم البشري، بينما توفر إطارًا للدراسات الحالية والمستقبلية. لقد أنشأ اتحاد مشروع الميكروبيوم البشري إطارًا على مستوى السكان لدراسة مجموعة متنوعة من المجتمعات الميكروبية التي توجد في جميع أنحاء جسم الإنسان، مما يمكّن من إنتاج مجموعة من البيانات الخاضعة لمراقبة الجودة بالإضافة إلى موارد المجتمع. يهدف مشروع الميكروبيوم البشري (HMP)، المدعوم من صندوق المعاهد الوطنية للصحة المشترك، إلى وصف المجتمعات الميكروبية التي تسكن وتتفاعل مع جسم الإنسان في المرض والصحة. في مقالتين في هذا العدد من مجلة Nature، يقدم اتحاد HMP التفاصيل الأولى على مستوى السكان حول التركيب الكائناتي والوظيفي للميكروبيوتا عبر خمسة مناطق من الجسم. يناقش مقال إخباري مصاحب النتائج الأولية - التي، إلى جانب تلك الخاصة بسلسلة من المنشورات المشتركة، تشكل بالفعل أكبر كتالوج للكيانات والجينات المتعلقة بالميكروبيوم البشري تم نشره حتى الآن - ويسلط الضوء على بعض الأسئلة الرئيسية التي سيتناولها المشروع في السنوات القليلة القادمة.