Skylign: أداة لإنشاء شعارات معلوماتية وتفاعلية تمثل محاذاة التسلسل ونماذج ماركوف المخفية.

الخلفية: تُستخدم الشعارات عادةً في البيولوجيا الجزيئية لتوفير تمثيل رسومي مضغوط لنمط الحفظ لمجموعة من التسلسلات. حيث تقدم المعلومات الموجودة في محاذاة التسلسل أو نماذج ماركوف المخفية من خلال رسم كومة من الحروف لكل موضع، حيث يتناسب ارتفاع الكومة مع مستوى الحفظ عند ذلك الموضع، وارتفاع كل حرف داخل الكومة يعتمد على تواتر ذلك الحرف عند ذلك الموضع. النتائج: نقدم أداة جديدة وخدمة ويب، تُسمى Skylign، التي توفر إطارًا موحدًا لإنشاء شعارات لكل من محاذاة التسلسل ونماذج ماركوف المخفية. بالإضافة إلى ملفات الصور الثابتة، تقوم Skylign بإنشاء مخطط شعار تفاعلي جديد لإدراجه في صفحات الويب. تتيح هذه الشعارات التفاعلية التمرير، والتكبير، والتفتيش على القيم الأساسية. يمكن لـ Skylign تجنب انحياز العينة في محاذاة التسلسل عن طريق تقليل وزن التسلسلات الزائدة ودمج العد الملاحظ مع الأولويات المستنيرة. كما أنها تبسط تمثيل معلمات الفجوة، ويمكن أن تكبر ارتفاعات الحروف بناءً على حسابات بديلة لحفظ الموضع. الخلاصة: تتوفر Skylign كمنصة على الإنترنت، وكمجموعة خدمات ويب يمكن البرمجة لها بواجهة RESTful، وكنظام برمجي للتنزيل. يمكن دمج شعارات Skylign التفاعلية بسهولة في صفحة ويب بضع سطور من علامة HTML. يمكن العثور على Skylign على http://skylign.org.