امتدادات طريقة محاكاة الديناميكا الجزيئية. II. الأنظمة الحرارية

في هذه الورقة، نقوم بتطوير نظامي عامين من معادلات الحركة لأداء محاكاة الديناميكا الجزيئية عند درجة حرارة ثابتة بشكل منهجي. وُجد أن أحد الأعضاء من كل نظام يتطابق مع أحد الطريقتين المستخدَمتين عادة في إجراء مثل هذه المحاكاة. ومن بين هاتين الطريقتين، واحدة، وهي إجراء قياس الزخم، ثبت أنه ليس له تأثير على الخصائص الثابتة للنظام المحاكى. بالإضافة إلى ذلك، قمنا باختبار الطريقتين من خلال الديناميكا الجزيئية التوازنية على سائل لِنارد-جونز ووجدنا أن وظائف الذاكرة التلقائية الناتجة ومعاملات الانتشار الذاتي تتماشى بشكل جيد مع تلك التي تحددها طريقة الديناميكا الجزيئية القياسية NVE.