تكرار وتوزيع طفرات Notch في خطوط خلايا الورم

ترتبط إشارات Notch غير المنظمة بمجموعة متنوعة من الأورام، ومن ثم فإنه من المهم معرفة المزيد عن تكرار وتوزيع طفرات Notch في سياق الورم. في هذا التقرير، نستخدم بيانات من موسوعة خطوط خلايا السرطان التي تم تطويرها مؤخرًا لتقييم تكرار وتوزيع طفرات Notch في مجموعة كبيرة من خطوط خلايا السرطان في السيلكو. تُظهر نتائجنا أن تكرار الطفرات في جينات مستقبلات وركائز Notch يُعادل تكرار الطفرات للجينات المسرطنة المعروفة ويفوق مجموعة من الجينات المنزلية. تم العثور على الطفرات عبر جميع جينات مستقبلات Notch الأربعة، لكن مع اختلافات ملحوظة بين المجالات البروتينية، كانت الطفرات مثلًا أكثر انتشارًا في المناطق المشفرة لمجالات LNR وPEST في النطاق داخل الخلوي لمستقبل Notch. علاوة على ذلك، أظهرت تقديرات التأثير الوظيفي في السيلكو أن الطفرات الضارة تتجمع في مجالات ربط الركيزة والمجالات داخل الخلوية من NOTCH1. بالنسبة لمعظم مجموعات خطوط الخلايا، فإن تكرار طفرات جينات Notch أعلى من تلك الموجودة في الأورام الأولية المرتبطة بها. تلقي نتائجنا الضوء الجديد على طيف طفرات Notch بعد الزراعة في المختبر لخلايا الورم. يشير التكرار الأعلى للطفرات في خطوط خلايا الورم إلى أن طفرات Notch مرتبطة بميزة نمو في المختبر، وبالتالي يمكن اعتبارها طفرات قيادة في سياق خط خلايا الورم.