تحليل متعدد الأوميات يكشف عن وحدات جينية مثبطة للورم وعاملة للورم في استجابة نقص الأكسجين الحادة

التكيف الخلوي مع نقص الأكسجين هو سمة بارزة للسرطان، لكن المساهمة النسبية لعوامل نقص الأكسجين (HIFs) مقابل حساسات الأكسجين الأخرى في تكوين الأورام غير واضحة. نحن نستخدم خط أنابيب متعدد الأوميات يتضمن قياسات RNA الناشئة لتوصيف التغيرات النسخية عند نقص الأكسجين الحاد. نحدد استجابة نسخية مبكرة فورية تعتمد بشدة على HIF1A ونشاط كيناز العامل المرافق له CDK8، وتشمل قمعاً غير مباشر لهدف MYC، وتحافظ على درجة عالية من الحفظ عبر أنواع السرطان. يقود HIF1A هذه الاستجابة الحادة عبر معززات عالية الإشغال محفوظة. تشير بيانات الفحص الجيني إلى أنه، في الظروف الطبيعية، يظهر HIF1A تأثيرات مثبطة للورم ذاتية خلوية قوية من خلال وحدة جينية تعمل على تثبيط mTOR. على النقيض من ذلك، في الأورام المتقدمة، يرتبط التعبير عن وحدة من أهداف HIF1A المعنية بإعادة تشكيل الكولاجين بتوقعات سلبية عبر أنواع السرطان المختلفة. في هذا العمل، نقدم موردًا قيمًا للتحقيق في الأدوار المعتمدة على السياق لـ HIF1A وأهدافه في بيولوجيا السرطان.