Key points are not available for this paper at this time.
تنظم مجموعة موارد تصميم الأدوية (D3R) تحديات عمياء لمواجهة أحدث التطورات في الأساليب الحسابية لتنبؤ وضع الجزيئات، وتقييم القوة، وحسابات الطاقة الحرة. في سياق التحدي الكبير الثاني من D3R، تم إجراء عدة تنبؤات عمياء لطاقة الربط الحرة لسلسلتين متشابهتين من مثبطات مستقبلات الفارسينويد X (FXR) باستخدام تدفق عمل شبه آلي لحساب الطاقة الحرة الكيميائية، والذي يتضمن أدوات برمجية مثل FESetup وSOMD. لوحظ أداء معقول في التحليلات الاستعادية لمجموعات بيانات الأدبيات. ومع ذلك، كانت التنبؤات العمياء على مجموعات بيانات D3R الكاملة ضعيفة بسبب الصعوبات التي واجهت في تصنيف المركبات التي تختلف في شحنتها الكلية. زاد الأداء للتنبؤات التي كانت مقيدة بمجموعات فرعية من المركبات التي تحمل نفس الشحنة الصافية. حافظ الكشف عن الأوضاع المرتبطة بالتبلور بالأشعة السينية أو حسّن الارتباط بالتجربة في جولات لاحقة من التنبؤات. كانت أفضل البروتوكولات أداءً على مجموعة D3R 1 و 2 مقارنة أو متفوقة على التنبؤات التي أُجريت بناءً على تحليل علاقات نشاط الهيكل الأدبي (SAR) فقط، ومقارنة أو أقل قليلاً من أفضل المشاركات من مجموعات أخرى.
درس مي وآخرون (Sun) هذا السؤال.