Análisis de la diversidad genética y la estructura genética de los cerdos negros de Jiangshan utilizando chips de polimorfismo de nucleótido único (SNP)

El cerdo negro de Jiangshan es una raza de cerdo indígena de China, reconocida por su calidad de carne superior y su adaptabilidad a forrajes. Sin embargo, la población de cerdos negros de Jiangshan ha disminuido debido a la introducción de razas de cerdos cosmopolitas y al brote de peste porcina africana, lo que los pone en riesgo de extinción. Para ofrecer información sobre la conservación y cría de cerdos negros de Jiangshan, este estudio involucró a 118 cerdos negros de Jiangshan como sujetos de investigación y empleó el chip Zhongxin-1 Porcine Breeding Array PLUS para detectar SNPs en todo el genoma. Además, se utilizaron diversas herramientas de software para analizar con precisión la diversidad genética, la relación filogenética, el coeficiente de endogamia y la estructura de pedigrí de la población de conservación del cerdo negro de Jiangshan. Los hallazgos indicaron que el tamaño efectivo de la población (Ne) del cerdo negro de Jiangshan era de 4.9, con un coeficiente de endogamia promedio de 0.253 dentro de la población. Un análisis de relación genética identificó que los 16 cerdos machos se agruparon en cuatro familias, y las 100 cerdas también fueron asignadas a estos grupos familiares. Además, dos cerdas fueron clasificadas como "otras" debido a su lejana relación genética con todos los machos. Estos resultados contribuyen a una mejor comprensión del estado actual de la conservación de la población de cerdos negros de Jiangshan y ofrecen una base teórica para el desarrollo de estrategias de conservación.