Mapeo funcional de alta resolución de RAD51C mediante edición genómica por saturación

Las variantes patogénicas en RAD51C confieren un riesgo elevado de cáncer de mama y ovario, mientras que los individuos homocigotos para alelos específicos de RAD51C pueden desarrollar anemia de Fanconi. Utilizando la edición genómica por saturación (SGE), evaluamos funcionalmente 9,188 variantes únicas, incluyendo más del 99.5% de todas las posibles alteraciones de nucleótidos en la secuencia codificante. Al calcular cambios en la abundancia de variantes y modelado de mezcla gaussiana (GMM), clasificamos funcionalmente 3,094 variantes como disruptivas y utilizamos conjuntos de verdad clínica para revelar una precisión/concordancia en la clasificación de variantes del >99.9%. La fitness celular fue la lectura principal del ensayo que nos permitió observar un fenómeno donde variantes específicas de sentido erróneo exhiben cinéticas de depleción distintas, sugiriendo potencialmente que representan alelos hipomórficos. Exploramos además nuestro mapa funcional exhaustivo, revelando residuos críticos en la estructura de RAD51C y resolviendo variantes encontradas en linajes segregadores de cáncer. Además, a través de la investigación en el Biobanco del Reino Unido y una gran cohorte multi-centro de cáncer de ovario, encontramos asociaciones significativas entre variantes depletadas por SGE y diagnósticos de cáncer.