Alteraciones en la microbiota esofágica local y resultados después de la esofagectomía por cáncer esofago-gástrico: un estudio piloto

Resumen El cáncer esofágico es una carga global para la salud, con un estimado de 600,000 nuevos casos y 550,000 muertes al año. Es el 9º cáncer más común y se clasifica como el quinto en mortalidad relacionada con el cáncer. La estrategia curativa de referencia actual incluye la esofagectomía, que es un procedimiento mórbido. En particular, las fugas anastomóticas son una complicación temida en el postoperatorio que resulta en una morbilidad significativa. Los estudios de pacientes que se someten a cirugía por cáncer colorrectal muestran que las alteraciones en la microbiota local pueden contribuir a complicaciones, incluidas las fugas anastomóticas. Además, algunas especies bacterianas patógenas han sido implicadas en períodos más cortos de supervivencia libre de recurrencia después de la cirugía oncológica curativa. A diferencia del cultivo bacteriano, que requiere que las bacterias viables sean preservadas desde el momento de la toma de muestra hasta el procesamiento, la secuenciación de ARN 16S puede realizarse en tejidos frescos y fijos. Sin embargo, hay pocos estudios utilizando cualquiera de las fuentes de tejido y, hasta la fecha, ninguno que compare los resultados de los mismos pacientes. Los objetivos de este estudio piloto fueron: 1. Evaluar la viabilidad de probar muestras histológicas archivadas (es decir, fijas en formalina) que, a su vez, facilitan el análisis retrospectivo de pacientes con resultados clínicos conocidos (es decir, fugas anastomóticas). 2. Identificar cualquier diferencia (varianza, reducción o sobreabundancia) entre la microbiota de los pacientes que sufrieron una fuga anastomótica y aquellos que no la sufrieron. 3. Generar datos preliminares para informar sobre los tamaños de las muestras, los métodos estadísticos, el flujo de trabajo y el costo de un futuro ensayo prospectivo. Usando una base de datos establecida de cirugía de cáncer gastrointestinal superior, realizamos un emparejamiento por puntuación de propensión para identificar a 15 pacientes que tenían una fuga anastomótica clínicamente evidente y emparejarlos con 15 pacientes que no tenían fuga anastomótica. Se han controlado los predictores conocidos de fuga anastomótica (p. ej., radioterapia neoadyuvante, estado de fumador, EPOC, enfermedad renal crónica, diabetes mellitus, enfermedad hepática crónica). Estaban disponibles muestras frescas congeladas y fijadas en formalina para los mismos pacientes. El tejido fijado en formalina estaba compuesto por los "donuts anastomóticos" creados en el momento de la anastomosis circular con grapas. Se eligió este tejido debido a su proximidad inmediata a la anastomosis. Todas las muestras fueron analizadas usando secuenciación de ARN 16S para obtener un perfil microbiano completo. Los datos de secuenciación fueron analizados por investigadores científicos cegados al resultado clínico (es decir, fuga anastomótica vs. sin fuga) utilizando un flujo de trabajo y un pipeline bioinformático preexistente.