Las inusuales propiedades estructurales y la potencial relevancia biológica del ADN switchback

Resumen Los motivos de ADN sintético forman la base de la nanotecnología de ácidos nucleicos. Las propiedades bioquímicas y biofísicas de estos motivos determinan sus aplicaciones. Aquí, presentamos una caracterización detallada del ADN switchback, una estructura globalmente zurda compuesta por dos hebras de ADN paralelas. En comparación con un dúplex convencional, el ADN switchback muestra una menor estabilidad termodinámica y requiere una mayor concentración de magnesio para su ensamblaje, pero exhibe una mayor biostabilidad contra algunas nucleasas. Experimentos de competencia de cadenas y desplazamiento de cadenas muestran que las secuencias componentes tienen una preferencia absoluta por los complementos de dúplex en lugar de sus socios switchback. Además, hipotetizamos un papel potencial para el ADN switchback como una estructura alternativa en secuencias que contienen repeticiones cortas en tándem. Junto con experimentos de unión de moléculas pequeñas y estudios celulares, nuestros resultados abren nuevas avenidas para el ADN switchback en biología y nanotecnología.