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Este protocolo se utiliza para el metabarcoding de eDNA del gen 18S SSU rRNA (Balzano et al 2015) utilizando la secuenciación Pair-End Illumina Miseq. Como parte del Programa de Observación Oceánica del Instituto Hakai, se han recolectado muestras biomoleculares semanalmente, desde 0 m hasta cerca del fondo (260 m), para caracterizar genéticamente las comunidades de plancton en el Mar Salish del Norte desde 2015. Este protocolo se desarrolla para proporcionar anotaciones taxonómicas del ADN nuclear de eucariotas.
Carvalho et al. (Vie,) estudiaron esta cuestión.