La secuenciación de ARN de núcleo único robusta revela la dinámica de poblaciones celulares específicas del depósito en la remodelación del tejido adiposo durante la obesidad

RESUMEN La secuenciación de ARN de núcleo único (snRNA-seq), una alternativa a la secuenciación de ARN de célula única (scRNA-seq), enfrenta desafíos técnicos en la obtención de núcleos y ARN de alta calidad, obstaculizando persistentemente sus aplicaciones. Aquí, presentamos una técnica robusta para aislar núcleos a través de varios tipos de tejidos, mejorando notablemente la calidad de los datos de snRNA-seq. Utilizando este enfoque, caracterizamos de manera integral la dinámica celular dependiente del depósito de varios tipos celulares que subyacen a la remodelación del tejido adiposo durante la obesidad. Al integrar la secuenciación de ARN nuclear masiva de núcleos de adipocitos de diferentes tamaños, identificamos subpoblaciones distintivas de adipocitos categorizadas por tamaño y funcionalidad. Estas subpoblaciones siguen dos trayectorias divergentes, adaptativas y patológicas, con su prevalencia variando según el depósito. Específicamente, identificamos una característica molecular clave de los adipocitos hipertóficos disfuncionales, un apagón global en la expresión génica, junto con respuestas inflamatorias y de estrés elevadas. Además, nuestro análisis de expresión génica diferencial revela contribuciones distintas de las subpoblaciones de adipocitos a la fisiopatología general del tejido adiposo. Nuestro estudio establece un método robusto de snRNA-seq, proporcionando nuevos conocimientos sobre los procesos biológicos involucrados en la remodelación del tejido adiposo durante la obesidad, con una aplicabilidad más amplia en diversos sistemas biológicos.