Perspectivas moleculares de los datos de perfil genómico integral en cáncer colorrectal metastásico avanzado en la población del sur de Asia: un estudio observacional retrospectivo

RESUMEN Antecedentes: Se ha informado un aumento en la incidencia de cáncer colorrectal en India, presentándose a menudo en etapas avanzadas y resultando en una baja supervivencia. Sin embargo, el paisaje genómico y terapéutico no se entiende bien. Objetivo: El objetivo principal del estudio fue entender el perfil mutacional del cáncer colorrectal metastásico en la cohorte del sudeste asiático, y el objetivo secundario fue definir la proporción de pacientes con variantes terapéuticamente significativas. Materiales y Métodos: Este estudio retrospectivo se llevó a cabo entre enero de 2021 y septiembre de 2023, en 4baseCare Onco Solutions Pvt. Ltd., Bengaluru, Karnataka, India. Se realizó un perfil genómico integral (CGP) y pruebas de biomarcadores para MSI, TMB y PD-L1 en 477 pacientes con cáncer colorrectal metastásico avanzado (Etapas III/IV), para el actual estudio observacional retrospectivo. Resultados: Con CGP, identificamos variantes impulsores/clinicamente accionables en el 78.6% de la cohorte (375 pacientes). Aunque el 30.8% de nuestra cohorte (147 pacientes) era elegible para terapia dirigida disponible, el 29.5% (141 pacientes) presentaron variantes que conferían resistencia terapéutica. La frecuencia combinada de mutaciones de APC, TP53 y KRAS fue >50%, mientras que KRAS constituyó >90% de todas las mutaciones de RAS. Los genes de reparación de desajustes (MMR) incluyendo MLH1, MLH3, MSH3 y POLE se encontraron exclusivamente en cánceres de colon. Se observaron alteraciones genómicas en varios genes de significado pronóstico/terapéutico (mutaciones en PIK3CA, SMAD4, BRAF y amplificaciones en KRAS, EGFR y ERBB2). De los estudiados, el 15.8% (41 pacientes) de la cohorte tenía una alta carga mutacional tumoral (TMB-H), el 14% tenía alta inestabilidad de microsatélites (MSI-H) (46 pacientes) y el 26.8% fue positivo para el ligando 1 de muerte programada (PD-L1) (30 pacientes). Conclusión: Nuestro estudio muestra que el CGP es una opción ventajosa para identificar subconjuntos de pacientes elegibles para diversas terapias dirigidas, mejorando así los resultados en los pacientes.