scRNA‐seq determina las características de los genes de marcador de células T para predecir el pronóstico del cáncer esofágico

Resumen El cáncer esofágico (CE) incluye principalmente dos subtipos histológicos, carcinoma de células escamosas esofágicas (CCEE) y adenocarcinoma esofágico, que presenta alta morbilidad y mortalidad. Con el continuo desarrollo de la tecnología médica, el tratamiento del CE ha mejorado considerablemente, pero su pronóstico sigue siendo desfavorable. La reciente secuenciación de ARN de célula única (scRNA‐seq) se espera que aporte avances en el tratamiento del CE. Primero, identificamos los genes de marcador de células T y generamos una firma analizando los datos de scRNA‐seq de la base de datos Expression Omnibus (GEO) y de la base de datos TCGA. Luego, se construyó un modelo de pronóstico inmune utilizando el operador de selección y reducción absoluta mínima. Encontramos que la tasa de supervivencia del CCEE varió significativamente entre los grupos de bajo y alto riesgo. Dos genes de la firma de células T, DCPS y CYB5R3, se expresaron en células de CCEE. En conjunto, nuestro estudio propuso una nueva firma pronóstica para pacientes con CCEE basada en genes de marcador de células T.