Síntesis, estudios antimicrobianos y en silico de derivados de citidina 5′-O-sustituidos: la cinamoylación conduce a una mejora de la actividad antimicrobiana

Los derivados de nucleósidos son importantes fármacos terapéuticos que han llamado significativamente la atención recientemente. En este estudio, la citidina (1) fue expuesta a reaccionar con cloruro de cinamilo en N,N-dimetilformamida y trimetilamina para obtener 5′-O-(cinamilo)citidina, que fue tratada posteriormente con varios agentes acilantes para obtener una serie de derivados de 2′,3′-di-O-acilo. Las estructuras químicas de los compuestos sintetizados se establecieron mediante técnicas espectrales, analíticas y fisicoquímicas. Se evaluó la eficacia antimicrobiana in vitro, y el efecto antimicrobiano fue mayor que el del compuesto precursor; en particular, el compuesto 3 mostró la actividad más prometedora. Las mediciones de citotoxicidad revelaron que los compuestos demostraron un grado de toxicidad reducido. Un estudio de relación estructura-actividad (SAR) mostró que el moiety de ribosa combinado con las cadenas acilo (C-12/C13) y (C6H5CH = CHCO) tuvo efectos mejorados sobre bacterias y hongos. Se aplicó acoplamiento molecular para los inhibidores potenciales (3, 4 y 6) para predecir su modo de acción y confirmar su eficacia contra isoenzimas, la proteína similar a la tubulina TubZ, Bacillus cereus PDB: 4ei9, y la dihidrofolato reductasa de Aspergillus flavus PDB: 6dtc. Se realizó un estudio de simulación de dinámica molecular para evaluar la deformabilidad, flexibilidad y rigidez de los residuos de la enzima diana. La teoría de funcionales de densidad (DFT) indica la alta polarizabilidad y reactividad química de los compuestos sintetizados. El estudio ADMET (absorción, distribución, mecanismo, excreción y toxicidad) sugirió que todas las moléculas diseñadas tienen una absorción intestinal humana moderada y buenos valores de distribución, además de la ausencia de efectos secundarios en el sistema nervioso central y toxicidad estructural. Sobre todo, estos derivados de citidina poseen un comportamiento antimicrobiano potencial, lo que los convierte en candidatos a fármacos adecuados para exploración adicional.