Resumen 7354: Caracterización proteogenómica y metabolómica de la leucemia mieloide aguda

Resumen La leucemia mieloide aguda (AML) es una malignidad sanguínea de mal pronóstico con marcada heterogeneidad. Para dilucidar los mecanismos subyacentes que impulsan la AML como parte del esfuerzo del Consorcio Clínico de Análisis Proteómico de Tumores (CPTAC), realizamos una caracterización integral de genómica, transcriptómica, proteómica incluyendo múltiples modificaciones postraduccionales (fosforilación, acetilación y glicosilación), metabolómica y lipidómica en 173 pacientes con AML sin tratamiento previo. Aplicando el método de fusión de redes de similitud tanto a datos transcriptómicos como proteómicos, identificamos 8 grupos proteogenómicos. Estos grupos recapitulan mutaciones recurrentes específicas y subtipos clínicos establecidos disponibles dentro de la cohorte. Usamos datos de secuenciación de ARN de célula única como referencia para realizar análisis de componentes inmunes en las muestras colectadas a granel. El resultado revela que nuestro agrupamiento proteogenómico también capta las variaciones de las jerarquías de diferenciación de la AML, incluyendo AML tipo monocito-like CD14+ y tipo GMP-like. Para evaluar la compleja naturaleza de la enfermedad AML, realizamos un análisis funcional para cada grupo que revela la interacción entre múltiples aberraciones genómicas tales como mutaciones en NPM1, FLT3-ITD, DNMT3A, alteraciones cromosómicas complejas y la diferenciación celular leucémica. Es importante destacar que el análisis multi-ómico realizado no solo conecta los impulsores moleculares previamente identificados y las variaciones en la diferenciación celular dentro de la AML, sino que también las vincula con la reprogramación metabolómica del cáncer observada y sus implicaciones en la respuesta a fármacos. Además, nuestro estudio identificó modificaciones postraduccionales específicas de sitio previamente desconocidas en la AML, destacando los valiosos conocimientos y la relevancia clínica de estos nuevos grupos identificados. Formato de cita: Alec Chu, Yi Hsiao, Yamei Deng, Chenwei Wang, Jennifer Kyle, Yongchao Dou, James C. Pino, Camilo Posso, Leanne Henry, Lijun Chen, Ginny Xiaohe Li, Tung-Shing Mamie Lih, Yifat Geffen, Fengchao Yu, Li Ding, Gil Omenn, Chandan Kumar, Saravana M. Dhanasekaran, Elie Traer, Jeffrey W. Tyner, Hui Zhang, Tao Liu, Sara Gosline, Bing Zhang, Arul Chinnaiyan, Alexey I. Nesvizhskii, Marcin Cieslik, The CPTAC Consortium. Proteogenomic and metabolomic characterization of acute myeloid leukemia abstract. En: Actas de la reunión anual de la Asociación Americana para la Investigación del Cáncer 2024; Parte 1 (Resumenes regulares); 5-10 abr 2024; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84 (6Suppl): Resumen nº 7354.