Aumentando la sostenibilidad en la paleoproteómica al optimizar los tiempos de digestión para análisis arqueológicos de huesos a gran escala

El análisis paleoproteómico de los proteomas esqueléticos se utiliza para proporcionar identificaciones taxonómicas para un número creciente de especímenes arqueológicos. La tasa de éxito depende de una variedad de factores tafonómicos y diferencias en los protocolos de extracción empleados. Al analizar 12 especímenes óseos arqueológicos de dos sitios arqueológicos, demostramos que reducir la duración de la digestión de 18 a 3 horas no tiene un impacto medible en las identificaciones taxonómicas obtenidas. La recuperación de marcadores peptídicos, la cobertura de secuencia de COL1 o la complejidad del proteoma tampoco se ven significativamente afectadas. Aunque observamos diferencias menores en la cobertura de secuencia y la desamidación de glutamina, estas no son consistentes en nuestro conjunto de datos. Una reducción de 6 veces en el tiempo de digestión reduce el consumo de electricidad y, por lo tanto, las intensidades de emisión de CO2. Además, demostramos que trabajar en placas de 96 pocillos reduce aún más el consumo de electricidad en un 60%, en comparación con microtubos individuales. Por lo tanto, reducir el tiempo de digestión no tiene impacto en las identificaciones taxonómicas, mientras reduce el impacto ambiental de los proyectos de paleoproteómica.