Análisis basado en bioinformática de características relacionadas con el metabolismo de aminoácidos para predecir el pronóstico clínico y la respuesta a la inmunoterapia en el cáncer de mama triple negativo

Resumen El cáncer de mama triple negativo (CMTN) es un subtipo agresivo de cáncer de mama asociado con un mal pronóstico. Además del efecto Warburg, los aminoácidos y metabolitos afectan el desarrollo tumoral, están involucrados en la modulación del microentorno inmune tumoral (TME) y regulan la respuesta inmune antitumoral. Sin embargo, la relación entre el metabolismo de aminoácidos y el pronóstico clínico y la respuesta inmunoterapéutica del cáncer de mama triple negativo sigue siendo indistinta. Establecimos una firma de riesgo compuesta por 12 genes mediante análisis diferencial, análisis de regresión COX univariado y análisis LASSO-COX. La cohorte GEO confirmó la validez de la firma de riesgo. Utilizamos análisis de enriquecimiento genómico de muestra única (ssGSEA), carga mutacional tumoral (TMB) y valores de IC50 de medicamentos para descubrir la relación entre la firma de riesgo, el estado inmune y la sensibilidad a fármacos en CMTN. También verificamos la expresión del gen de la firma de riesgo ALDH4A1 en tejidos y células mediante ensayo de qPCR, y el ensayo de migración verificó su papel en la invasión de células de CMTN. Nuestro estudio puede proporcionar nuevas perspectivas sobre la terapia metabólica de aminoácidos para el tratamiento de pacientes con CMTN.