El banco de datos de proteínas (PDB) archiva estructuras tridimensionales (3D) de macromoléculas determinadas experimentalmente mediante varios métodos. Es gestionado conjuntamente por el consorcio Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). El Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) PDB, el centro de datos de EE. UU. para el PDB, ofrece acceso simplificado a más de 240,000 estructuras a través de una variedad de herramientas enfocadas en la investigación en RCSB.org. Además, RCSB.org pone a disposición más de 1 millón de modelos de estructura computados predichos utilizando métodos de aprendizaje profundo y archivados en la base de datos AlphaFold y ModelArchive. El sistema PDB-IHM se desarrolló como un proyecto del wwPDB basado en recomendaciones de la comunidad para archivar estructuras determinadas mediante métodos integrativos/híbridos (IHM). Estas estructuras se computan combinando información de múltiples técnicas experimentales y computacionales para superar las limitaciones de los métodos tradicionales únicos (por ejemplo, cristalografía de macromoléculas, microscopía electrónica 3D, espectroscopía de resonancia magnética nuclear). En 2024, el PDB-IHM se unificó con el PDB para archivar estructuras integrativas junto con estructuras experimentales de un solo método. Posteriormente, estas estructuras integrativas se han hecho accesibles a través del sitio web RCSB.org, facilitando la entrega eficiente de datos IHM a una amplia comunidad de usuarios del PDB. Se presentarán las capacidades expandidas de RCSB.org que apoyan el descubrimiento, análisis y visualización de estructuras integrativas junto con estructuras experimentales de un solo método y modelos de estructura computados.
Brinda Vallat (Sun,) estudió esta cuestión.