cellxgene: una plataforma de exploración eficiente y escalable para matrices dispersas de alta dimensión

Resumen Explorar rápidamente y de manera flexible conjuntos de datos de alta dimensión, como los datos de scRNAseq, está subatendido pero es fundamental para la generación de hipótesis, la anotación de conjuntos de datos, la publicación, el intercambio y la reutilización por parte de la comunidad. cellxgene es una interfaz web altamente generalizable para explorar conjuntos de datos de alta dimensión a lo largo de dimensiones categóricas, continuas y espaciales, así como la anotación de características. cellxgene se distingue por su capacidad para manejar de manera eficiente millones de observaciones, y cierra una brecha crítica al permitir que biólogos computacionales y experimentales formulen preguntas de manera iterativa sobre conjuntos de datos privados y públicos. Al hacerlo, cellxgene aumenta la utilidad y reutilización de los conjuntos de datos en todo el ecosistema de células individuales. El código puede ser accedido en https://github.com/chanzuckerberg/cellxgene. Para preguntas y consultas, comuníquese con cellxgene@chanzuckerberg.com.