Recientemente, se ha abogado ampliamente por un cambio de ontologías basadas en sustancias a ontologías basadas en procesos de los seres vivos y entidades biológicas, en gran medida porque el pensamiento tradicional sobre sustancias, al fomentar el reduccionismo biológico, no logra captar adecuadamente la naturaleza de los todo biológicos. En cambio, se considera que los enfoques basados en procesos proporcionan un marco metafísico más apropiado para la dinámica constitutiva de los sistemas vivos. Sin embargo, estos argumentos han sido criticados por depender de caracterizaciones demasiado reduccionistas de las sustancias, que tanto las cuentas clásicas como las contemporáneas describen como inherentemente implicando cambio y actividad. En este ensayo, abordo el debate entre sustancia y proceso desde la perspectiva de la biología celular contemporánea. Sostengo que concebir la célula como una sustancia no solo es compatible con la centralidad de los procesos, sino que la célula sigue funcionando como el punto de referencia fundamental en biología precisamente porque implica la procesualidad como intrínseca a su modo dinámico de ser. Dentro de este marco, las entidades subcelulares se identifican por su subordinación funcional al todo celular. Con base en esto, propongo un criterio empíricamente fundamentado para distinguir entre entidades subcelulares puramente procesuales y de tipo sustancial. Las entidades procesuales, como el complejo de Golgi y el nucléolo, carecen de sistemas de reparación dedicados y tienden a desensamblarse al inhibirse actividades metabólicas específicas. Por el contrario, las entidades de tipo sustancial, incluidos orgánulos derivados de células como la mitocondria y el núcleo, dependen para su persistencia de sistemas de reparación específicos, y su eventual desmantelamiento en condiciones no permisivas no puede entenderse de manera sencilla como la mera interrupción de un proceso, sino que aparece como el resultado de una respuesta activa y regulada.
Giorgio Dieci (martes,) estudió esta cuestión.