Опухоли молочной железы собак (ОМС) являются отличной моделью рака молочной железы человека благодаря своему спонтанному происхождению и иммунологическому сходству. В данном исследовании проведена двойная иммунная деконволюция — EPIC и CIBERSORTx — данных транскриптомного секвенирования (GSE136197) из 48 образцов опухолевых и нормальных тканей молочной железы собак для определения иммунного микроокружения опухоли. В опухолевых образцах выявлено значительное и статистически достоверное обогащение CD4⁺ T-клеток (коэновское d = –0,83, FDR < 0,01), которое прослеживается уже на стадии карциномы in situ. Анализ CIBERSORTx дополнительно позволил выделить покоящиеся и активированные клетки памяти CD4⁺ T, а также T-фолликулярные хелперы, что подчеркивает функциональное разнообразие. Полученные результаты свидетельствуют о сохранённом механизме иммунного ремоделирования с участием CD4⁺ T-клеток у собак и человека и демонстрируют, что комбинированная деконволюция EPIC–CIBERSORTx является экономичным способом получения высокодетализированных иммунных профилей, способных служить основой для сравнительной онкологии и разработки иммунотерапии.
Ruwini Madhushika Herath Herath Mudiyanselage (Thu,) studied this question.