El secuenciamiento de algodón aloteraploide (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) proporciona un recurso para la mejora de la fibra

El algodón de meseta es un modelo para la domesticación de cultivos poliploides y la mejora transgénica. Aquí secuenciamos el genoma del aloteraploide Gossypium hirsutum L. acc. TM-1 integrando lecturas de escopeta de genoma completo, secuencias de extremos de cromosomas artificiales bacterianos (BAC) y mapas genéticos de genotipo por secuenciación. Montamos y anotamos 32,032 genes del subgenoma A y 34,402 genes del subgenoma D. Los reordenamientos estructurales, la pérdida de genes, los genes interrumpidos y la divergencia de secuencias fueron más comunes en el subgenoma A que en el subgenoma D, sugiriendo una evolución asimétrica. Sin embargo, no se encontró dominancia de expresión a nivel del genoma entre los subgenomas. Las firmas genómicas de selección y domesticación están asociadas con genes seleccionados positivamente (PSGs) para la mejora de la fibra en el subgenoma A y para la tolerancia al estrés en el subgenoma D. Esta secuencia de genoma borrador proporciona un recurso para la ingeniería de líneas de algodón superiores.