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Proponemos una teoría general de la reproducción clonal para protozoos parásitos, que tiene importantes consecuencias médicas y biológicas. Muchos protozoos parásitos se han asumido que se reproducen sexualmente, debido a la diploidia y la sexualidad ocasional en el laboratorio. Sin embargo, un análisis poblacional genético de datos extensos sobre polimorfismos bioquímicos indica que las dos consecuencias fundamentales de la reproducción sexual (es decir, segregación y recombinación) son aparentemente raras o ausentes en poblaciones naturales de protozoos parásitos. Además, los clones registrados parecen ser estables en amplias áreas geográficas y durante largos períodos de tiempo. Una estructura poblacional clonal exige que los atributos médicos de los clones sean caracterizados por separado; los clones ubicuos requieren una caracterización prioritaria. La reproducción uniparental hace que la taxonomía lineana sea insatisfactoria; esto necesita ser complementado por el "clon natural" como una unidad taxonómica adicional, que se define mejor mediante marcadores genéticos.
Tibayrenc et al. (Sun,) estudiaron esta cuestión.