El uso de diaminopurina para investigar las propiedades estructurales de los ácidos nucleicos y el reconocimiento molecular entre ligandos y ADN

La 2,6-Diaminopurina (DAP) es un análogo de la adenina que puede ser convertido en nucleótidos que sirven como sustratos para la incorporación en ácidos nucleicos por polímeras en lugar de (d)AMP. Se empareja con la timidina (o uracilo), formando tres enlaces de hidrógeno del tipo Watson-Crick. El resultado de la incorporación de DAP es añadir una considerable estabilidad a la doble hélice e impartir otras características estructurales, como un ancho de surco alterado y la interrupción de la espina normal de hidratación. El ADN que contiene DAP puede o no ser reconocido por las endonucleasas de restricción; el ARN que contiene DAP puede no participar en el empalme normal. El par DAP.T afecta la flexibilidad local del ADN e impide la interacción con proteínas que doblan la hélice. Al proporcionar un donador de enlace de hidrógeno no canónico en el surco menor y/o bloquear el acceso al fondo de ese surco, afecta fuertemente las interacciones con pequeñas moléculas como antibióticos y fármacos anticancerígenos. Se presentan ejemplos que ilustran el reconocimiento alterado de las secuencias de nucleótidos en el ADN que contiene DAP: sitios de corte cambiados por bleomicina, fotodegradación por nitrato de uranilo y huellas con mitramicina. Utilizando ADN en el cual se han realizado sustituciones A-->DAP y G-->Inosina, es posible evaluar con precisión el papel del grupo amino 2-purínico en el reconocimiento ligando-ADN.