TYGS es una plataforma automatizada de alto rendimiento para una taxonomía basada en genomas de última generación

La taxonomía microbiana está siendo cada vez más influenciada por métodos computacionales basados en el genoma. Sin embargo, tales análisis pueden ser complejos y requerir conocimientos especializados. Aquí presentamos TYGS, el Servidor de Genomas Tipo (Cepas), un servidor web amigable de alto rendimiento para la taxonomía procarionte basada en genomas, conectado a una gran base de datos, que crece continuamente, de información genética, taxonómica y nomenclatural. Inferimos filogenias a escala genómica y estimaciones de última generación para límites de especies y subespecies a partir de secuencias de genomas tipo más cercanas definidas por el usuario y determinadas automáticamente. TYGS también proporciona acceso integral a nomenclatura, sinonimia y literatura taxonómica asociada. Ejemplos clínicamente importantes demuestran cómo TYGS puede ofrecer nuevas perspectivas sobre la clasificación microbiana, como la evidencia de una separación a nivel de especie de subespecies de Salmonella enterica previamente propuestas. TYGS es un enfoque integrado para la clasificación de microbios que desbloquea nuevos enfoques científicos para microbiólogos en todo el mundo y es particularmente útil para el campo en rápida expansión de descripciones taxonómicas basadas en genomas de nuevos géneros, especies o subespecies.