JASPAR, la base de datos de acceso abierto de perfiles de unión de factores de transcripción: nuevo contenido y herramientas en la actualización de 2008

JASPAR es una base de datos de acceso abierto popular para modelos de matriz que describen preferencias de unión al ADN para factores de transcripción y otros patrones de ADN. Con su tercera gran versión, JASPAR se ha expandido y equipado con funciones adicionales dirigidas tanto a usuarios ocasionales como a expertos. El corazón de la base de datos JASPAR, la sub-base de datos JASPAR CORE, ha aumentado en un 12% en tamaño, y se han añadido tres nuevas sub-bases de datos especializadas. Las nuevas funciones incluyen la agrupación de modelos de matriz por similitud, la generación de matrices aleatorias mediante muestreo de conjuntos seleccionados de modelos existentes y una interfaz de programación de aplicaciones de servicio web independiente del lenguaje para la recuperación de matrices. JASPAR está disponible en http://jaspar.genereg.net.