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Las alteraciones en los genomas de cáncer influyen fuertemente en las respuestas clínicas al tratamiento y, en muchos casos, son potentes biomarcadores de respuesta a los fármacos. La base de datos Genómica de la Sensibilidad a Fármacos en Cáncer (GDSC) (www.cancerRxgene.org) es el recurso público más grande para información sobre sensibilidad a fármacos en células de cáncer y marcadores moleculares de respuesta a fármacos. Los datos están disponibles libremente sin restricciones. GDSC actualmente contiene datos de sensibilidad a fármacos para casi 75 000 experimentos, describiendo la respuesta a 138 fármacos anticancerígenos en casi 700 líneas celulares de cáncer. Para identificar marcadores moleculares de respuesta a fármacos, los datos de sensibilidad a fármacos de líneas celulares se integran con grandes conjuntos de datos genómicos obtenidos de la base de datos del Catálogo de Mutaciones Somáticas en Cáncer, incluyendo información sobre mutaciones somáticas en genes del cáncer, amplificación y deleción de genes, tipo de tejido y datos transcripcionales. El análisis de los datos de GDSC se realiza a través de un portal web centrado en identificar biomarcadores moleculares de sensibilidad a fármacos basado en consultas de fármacos anticancerígenos específicos o genes del cáncer. Se utilizan representaciones gráficas de los datos a lo largo de todo el documento con enlaces a recursos relacionados y todos los conjuntos de datos son completamente descargables. GDSC proporciona un recurso único que incorpora grandes conjuntos de datos de sensibilidad a fármacos y genómicos para facilitar el descubrimiento de nuevos biomarcadores terapéuticos para terapias contra el cáncer.
Yang et al. (Jue,) estudiaron esta cuestión.